生态系统是在一定的时间和空间内，生物和非生物之间通过物质循环和能量流动相互作用形成一个有机的整体。海南的生态系统包括海洋生态系统和陆地生态系统。

陆地生态系统: 草原( 热带稀疏草原湿地草原丘陵山地草坡)生态系统、农业(经济林园地农田)生态系统、城市生态系统、旅游生态系统、热带半落叶季雨林、热带常绿季雨林，沟谷雨林和山地雨林、针叶林和山地苔藓矮林生态系统。

珊瑚礁	又称“海底热带雨林”，海南的气候本来很适合珊瑚的生长，但由于近年来人为的挖掘和水体的污染，目前海南省50%的珊瑚礁受到破坏。珊瑚礁能保护海岸，免受海浪的浸蚀，又可吸收海洋中的二氧化碳，平恒温室效应。
红树林	目前海南大约三分之二的红树林已毁，但分布面积仍在我国占重要的地位，红树林能耐受潮汐浸泡和盐碱泥地的环境，防台风，固堤岸，防止碱潮入侵内陆，为内陆的天然屏障，但是近年来修港口，填海造田，开辟虾地，对红树林形成了极大的危害。
河口	海南岛共有入海河流154条，为最富有生产力的生态系统。淡水，矿物质和养料丰富，能够养育种类繁多的鱼虾和贝类带软体动物。修筑水坝，森林减少，河口的淡水含量减少，加上生活污水和工业污，导至河口的生态系统失调。
热带稀疏草原	主要是人工伐林后形成的次生植被，分布于海南西部的广大台地，适合林业和牧业的发展。但随着农业用地面积的增加，热带稀疏草原极少存在。
热带半落叶季雨林	位于海拔100-250米的丘陵或海谷，部分树种为落叶树种，由于农业用地面积加大，大部分被经济林或农田替代。
热带常绿季雨林、沟谷雨林和山地雨林	位于海拔200-1100米，由于海南连年砍伐，矿产开采，刀耕火种，天然林仅在五指山、尖峰顶和吊罗山等自然保护区有少量残存。
针叶林	现有面积极少，且大部分为人工林。由于砍伐过度，天然热带针叶林面积日益萎缩。
山地苔藓矮林	林木矮小且弯曲，上长满苔藓植物，为重要的水源涵养林。

红树林是热带海岸潮滩上中一种特殊的常绿林，它生长于风平浪静、淤泥深厚的海湾或河口高潮线以下的海滩。中国红树林主要分布于台湾、海南、广东和广西的沿海地段，组成红树林的种类有21种和38变种，其中主要是红树科植物，共有9种。红树林为复杂的生态系统，它为众多的鱼、虾、蟹、水禽和候鸟提供了栖息和觅食的场所。软体动物在红树林中约有百种以上。红树林的特殊生长环境造就了林中的特殊生态学特征，如叶片光亮、胎生现象、板根、呼吸根和支柱根等。红树林的砍伐，很多生物将失去栖息地。


红树林外貌	秋茄的板根与淤泥
以红树科秋茄树为主，位于平缓的海滩上，高潮时全被海水淹没，林冠整齐

红树科角果木的胎生现象	红树植物的花、果、呼吸根(右二)和支柱根(右)
种子在离开母体前就开始萌芽，胚轴逐渐再果中伸长而悬垂于果实的下端，长可达10厘米以上，发育到一定时期，然后脱落，坠入淤泥中，12小时内胚根即能长出数条根，固着在淤泥上	呼吸根的组织疏松，内有放射性的海绵通气组织，支柱根组织十分致密坚韧。